Cada año la Fundación Lilly, coincidiendo con su aniversario, tiene prevista la celebración de una reunión con representantes de los sectores a los que dirige sus actividades, en la que se presentará la memoria de lo realizado en el ejercicio, y que acogerá el Acto Académico de entrega de Premios de la Fundación.

Ha sido para la Fundación Lilly motivo de especial satisfacción contar con la presidencia de Don José Luís Rodríguez Zapatero, Presidente del Gobierno, en la cuarta Reunión Anual, quien hizo entrega de los Premios de Investigación Biomédica 2005 a los doctores Francisco Sánchez Madrid y Melchor Álvarez de Mon Soto, así como contar con la presencia de Doña Mª Jesús San Segundo, Ministra de Educación y Ciencia y de Doña Elena Salgado, Ministra de Sanidad y Consumo.